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Sanofi

Data Scientist principal, Bioinformatique et médecine de précision pilotée par l'IA - H/F

Data Scientist principal, Bioinformatique et médecine de précision pilotée par l'IA - H/F

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Date limite pour postuler : 20.11.22

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L'entreprise
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Sanofi est une entreprise mondiale des sciences de la vie qui s'engage à améliorer l'accès aux soins et à soutenir les personnes qu'elle sert tout au long du continuum de soins. De la prévention au traitement, Sanofi transforme l'innovation scientifique en solutions de santé, dans les domaines des vaccins humains, des maladies rares, de la sclérose en plaques, de l'oncologie, de l'immunologie, des maladies infectieuses, du diabète, des solutions cardiovasculaires et de la santé grand public. Chez Sanofi, plus de 110 000 personnes dans plus de 100 pays se consacrent à faire la différence dans le quotidien des patients, où qu'ils vivent, et à leur permettre de jouir d'une vie plus saine. En tant que société ayant une vision globale du développement de médicaments et une culture d'entreprise très appréciée, Sanofi est reconnue comme l'une des meilleures sociétés pharmaceutiques au monde et est pionnière dans l'application de l'intelligence artificielle (IA) dans l'organisation de la R&D, y compris la découverte de médicaments, la fabrication et le contrôle des produits chimiques, la recherche translationnelle, le développement clinique et la gestion et la soumission des documents réglementaires. Vous trouverez des détails sur l'organisation ainsi que sur la mission et les objectifs de l'entreprise sur notre site web.

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L'équipe
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L'intelligence artificielle (IA) et les algorithmes d'apprentissage automatique (ML) peuvent considérablement accélérer la découverte de médicaments et raccourcir le développement des médicaments et l'identification des patients pour les essais cliniques, créant ainsi de meilleurs médicaments qui sauvent des vies. AI and Deep Analytics (AIDA) est un groupe essentiel de l'organisation Data and Data Science (DDS) de Sanofi R&D qui se concentre sur les applications de l'IA/ML et du Deep Learning (DL) dans la conception de médicaments, la modélisation des maladies multi-omiques, le développement de médicaments et l'analyse des résultats des essais cliniques.  

Nos domaines de recherche et de développement actuels comprennent la science des données omiques ; la conception de médicaments biologiques ; le traitement du langage naturel (NLP) ; l'imagerie et la bioimagerie basées sur l'apprentissage profond pour la pathologie numérique et la biologie spatiale ; le traitement du signal numérique (DSP) et l'apprentissage automatique appliqués à la santé numérique et aux données générées par les patients à partir de wearables. Les 30 scientifiques de notre groupe viennent d'horizons divers en sciences informatiques et en ingénierie, avec une expertise approfondie en IA/ML, apprentissage profond, biostatistique et algorithmes.  

Les activités de l'équipe Omics Data Science sont consacrées à l'analyse d'ensembles complexes de données (multi-)omiques (principalement des données de séquençage en masse, unicellulaires, spatiales et des données de mots réels). Les objectifs de l'équipe sont de permettre une analyse avancée des données omiques pour soutenir et accélérer les projets du pipeline R&D (identification de biomarqueurs, stratification de patients, expansion d'indications, identification d'endotypes de maladies, identification de cibles...). L'équipe travaille avec les approches analytiques de pointe les mieux adaptées à la résolution des questions posées par les équipes de projet, mais adapte et développe également des outils si nécessaire.

Nous recherchons un Data Scientist principal spécialisé en bioinformatique et en médecine de précision pilotée par l'IA, avec une solide expérience en apprentissage automatique et en apprentissage profond appliqué à l'analyse d'ensembles de données omiques complexes, pour rejoindre notre équipe Omics Data Science (ODS).  Le candidat retenu relèvera du directeur de l'ODS et travaillera en étroite collaboration avec tous les groupes de médecine de précision de Sanofi R&D. Le poste est disponible en plusieurs endroits (Allemagne, France, États-Unis).

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L'offre
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Principales responsabilités :

  • Préparer et intégrer différents types de données omiques (QC, correction de lots...) y compris les données provenant d'expériences scRNAseq et de transcriptomique spatiale ;
  • Développer, mettre en œuvre et appliquer des méthodes de pointe basées sur le ML pour analyser de grands ensembles de données (multi-)omiques afin de soutenir et d'accélérer le portefeuille de projets de R&D de Sanofi ;
  • S'assurer que toutes les applications nouvellement développées sont accessibles à l'ensemble de la communauté des data scientists et des bioinformaticiens de Sanofi ;
  • Travailler au sein d'équipes de projet multidisciplinaires dans un contexte international (États-Unis, Europe, Chine). maintenir des interactions étroites avec d'autres data scientists ainsi que des scientifiques des départements d'immunologie, d'oncologie et de médecine de précision ;
  • Exécuter les plans de travail dans les délais, mettre à jour et communiquer les résultats pertinents aux équipes de projet interdisciplinaires et aux parties prenantes ;
  • Suivre constamment la littérature pour maintenir une connaissance approfondie des développements les plus récents en matière de science des données, de bioinformatique et d'algorithmes AI/ML/DL de pointe, ainsi que des dernières applications dans le domaine de la découverte de médicaments ;
  • S'engager activement dans l'évaluation et la coordination de collaborations universitaires et de startups.

À propos de vous

Formation et expérience professionnelle

  • Un doctorat en bioinformatique, science des données, biologie computationnelle, informatique ou sciences de l'ingénieur ;
  • 5+ ans d'expérience dans l'industrie ou dans le milieu universitaire avec un solide dossier de réalisations et une expérience de projet dans les applications de l'IA/ML dans les systèmes biologiques.  

Compétences générales

- Excellente attention aux détails et souci de l'excellence ;
- Solides compétences en communication écrite, orale et interpersonnelle ;
- Forte aptitude à travailler dans un environnement d'équipe multidisciplinaire ;
- De solides compétences en gestion de projet, notamment en matière d'organisation, de gestion du temps, d'établissement des priorités et de suivi, sont essentielles ;
- Compétences techniques ;
- Familiarité avec l'analyse de données omiques (y compris la transcriptomique unicellulaire et spatiale) ;
- Connaissance de l'apprentissage profond, des réseaux neuronaux, des encastrements et de l'apprentissage par transfert ;
- Connaissance de la visualisation des données et des algorithmes de réduction de la dimensionnalité ;
- Capacité à développer, évaluer et appliquer des algorithmes prédictifs pour générer des hypothèses ;
- Compétence en Python et/ou R ;
- Une expérience de l'analyse de déconvolution RNA-seq est un atout.

Langues

- Maîtrise de l'anglais.